MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Enterococcus faecalis D32 plasmid EFD32pA

Total Repeats: 195

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018222	TGT	2	6	15	20	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698493
2	NC_018222	CTCA	2	8	78	85	25 %	25 %	0 %	50 %	397698493
3	NC_018222	CTT	2	6	309	314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397698493
4	NC_018222	CA	3	6	331	336	50 %	0 %	0 %	50 %	397698493
5	NC_018222	AAG	2	6	341	346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
6	NC_018222	AAC	2	6	369	374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698493
7	NC_018222	CTA	2	6	398	403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397698493
8	NC_018222	AGC	2	6	495	500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397698493
9	NC_018222	AAT	2	6	504	509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698493
10	NC_018222	T	6	6	610	615	0 %	100 %	0 %	0 %	397698493
11	NC_018222	CAAA	2	8	663	670	75 %	0 %	0 %	25 %	397698493
12	NC_018222	ATA	2	6	674	679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698493
13	NC_018222	A	6	6	727	732	100 %	0 %	0 %	0 %	397698493
14	NC_018222	TTA	2	6	760	765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698493
15	NC_018222	ACGAA	2	10	767	776	60 %	0 %	20 %	20 %	397698493
16	NC_018222	TAG	2	6	797	802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698493
17	NC_018222	CT	4	8	824	831	0 %	50 %	0 %	50 %	397698493
18	NC_018222	AATAT	2	10	872	881	60 %	40 %	0 %	0 %	397698493
19	NC_018222	TAA	2	6	891	896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698493
20	NC_018222	AGA	2	6	915	920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
21	NC_018222	AAG	2	6	923	928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
22	NC_018222	ATTT	2	8	1037	1044	25 %	75 %	0 %	0 %	397698493
23	NC_018222	GGT	2	6	1055	1060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397698493
24	NC_018222	A	7	7	1072	1078	100 %	0 %	0 %	0 %	397698493
25	NC_018222	AGA	2	6	1116	1121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
26	NC_018222	A	6	6	1142	1147	100 %	0 %	0 %	0 %	397698493
27	NC_018222	CGA	2	6	1172	1177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397698493
28	NC_018222	A	6	6	1180	1185	100 %	0 %	0 %	0 %	397698493
29	NC_018222	GAA	2	6	1283	1288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
30	NC_018222	TGG	2	6	1290	1295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397698493
31	NC_018222	TTG	2	6	1321	1326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698493
32	NC_018222	A	6	6	1345	1350	100 %	0 %	0 %	0 %	397698493
33	NC_018222	GAA	2	6	1351	1356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698493
34	NC_018222	TA	3	6	1366	1371	50 %	50 %	0 %	0 %	397698493
35	NC_018222	TTTG	2	8	1467	1474	0 %	75 %	25 %	0 %	397698493
36	NC_018222	A	6	6	2274	2279	100 %	0 %	0 %	0 %	397698494
37	NC_018222	TTTA	2	8	2280	2287	25 %	75 %	0 %	0 %	397698494
38	NC_018222	GTG	2	6	2310	2315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397698494
39	NC_018222	CAA	2	6	2331	2336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698494
40	NC_018222	TTGAAA	2	12	2386	2397	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	397698494
41	NC_018222	GA	3	6	2429	2434	50 %	0 %	50 %	0 %	397698494
42	NC_018222	AGAAC	2	10	2490	2499	60 %	0 %	20 %	20 %	397698495
43	NC_018222	ATTGTT	2	12	2620	2631	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	397698495
44	NC_018222	ATA	2	6	2657	2662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698495
45	NC_018222	TGA	2	6	2678	2683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698495
46	NC_018222	TCAAAT	2	12	2685	2696	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	397698495
47	NC_018222	AATG	2	8	2733	2740	50 %	25 %	25 %	0 %	397698495
48	NC_018222	A	8	8	2820	2827	100 %	0 %	0 %	0 %	397698495
49	NC_018222	A	6	6	2866	2871	100 %	0 %	0 %	0 %	397698495
50	NC_018222	GTC	2	6	2885	2890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397698495
51	NC_018222	GAA	2	6	2971	2976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698495
52	NC_018222	AATC	2	8	2985	2992	50 %	25 %	0 %	25 %	397698495
53	NC_018222	A	6	6	3045	3050	100 %	0 %	0 %	0 %	397698495
54	NC_018222	A	6	6	3144	3149	100 %	0 %	0 %	0 %	397698496
55	NC_018222	TTG	2	6	3346	3351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698496
56	NC_018222	ATT	2	6	3378	3383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
57	NC_018222	GAAT	2	8	3538	3545	50 %	25 %	25 %	0 %	397698496
58	NC_018222	AAG	2	6	3562	3567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
59	NC_018222	ACA	2	6	3635	3640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698496
60	NC_018222	A	6	6	3732	3737	100 %	0 %	0 %	0 %	397698496
61	NC_018222	T	6	6	3743	3748	0 %	100 %	0 %	0 %	397698496
62	NC_018222	CA	3	6	3806	3811	50 %	0 %	0 %	50 %	397698496
63	NC_018222	TCT	2	6	3849	3854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397698496
64	NC_018222	AGA	2	6	3910	3915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
65	NC_018222	GTTT	2	8	3931	3938	0 %	75 %	25 %	0 %	397698496
66	NC_018222	AGT	2	6	3945	3950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698496
67	NC_018222	ATT	2	6	4031	4036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
68	NC_018222	TTA	2	6	4063	4068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
69	NC_018222	T	6	6	4118	4123	0 %	100 %	0 %	0 %	397698496
70	NC_018222	GTA	2	6	4177	4182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698496
71	NC_018222	CAA	2	6	4210	4215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698496
72	NC_018222	TACC	2	8	4222	4229	25 %	25 %	0 %	50 %	397698496
73	NC_018222	GAA	2	6	4326	4331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
74	NC_018222	ATCG	2	8	4370	4377	25 %	25 %	25 %	25 %	397698496
75	NC_018222	AAG	2	6	4393	4398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
76	NC_018222	ACA	2	6	4418	4423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698496
77	NC_018222	AGA	2	6	4430	4435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
78	NC_018222	ATT	2	6	4547	4552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
79	NC_018222	TGA	3	9	4583	4591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397698496
80	NC_018222	AAG	2	6	4612	4617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
81	NC_018222	TAT	2	6	4652	4657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
82	NC_018222	AT	3	6	4679	4684	50 %	50 %	0 %	0 %	397698496
83	NC_018222	TTG	2	6	4705	4710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698496
84	NC_018222	ATT	2	6	4727	4732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
85	NC_018222	A	8	8	4802	4809	100 %	0 %	0 %	0 %	397698496
86	NC_018222	TTA	2	6	4840	4845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698496
87	NC_018222	A	6	6	4854	4859	100 %	0 %	0 %	0 %	397698496
88	NC_018222	AGAA	2	8	4930	4937	75 %	0 %	25 %	0 %	397698496
89	NC_018222	AAG	2	6	4939	4944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698496
90	NC_018222	A	6	6	4948	4953	100 %	0 %	0 %	0 %	397698496
91	NC_018222	CAA	2	6	4982	4987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397698496
92	NC_018222	A	7	7	4997	5003	100 %	0 %	0 %	0 %	397698496
93	NC_018222	GTT	2	6	5014	5019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698496
94	NC_018222	AGAA	2	8	5061	5068	75 %	0 %	25 %	0 %	397698496
95	NC_018222	A	6	6	5067	5072	100 %	0 %	0 %	0 %	397698496
96	NC_018222	AT	3	6	5186	5191	50 %	50 %	0 %	0 %	397698496
97	NC_018222	GTGA	2	8	5332	5339	25 %	25 %	50 %	0 %	397698497
98	NC_018222	A	7	7	5395	5401	100 %	0 %	0 %	0 %	397698497
99	NC_018222	GTTCGT	2	12	5423	5434	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	397698497
100	NC_018222	AAG	2	6	5490	5495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698497
101	NC_018222	GT	3	6	5529	5534	0 %	50 %	50 %	0 %	397698497
102	NC_018222	ATA	2	6	5894	5899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698498
103	NC_018222	ACG	2	6	5963	5968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397698498
104	NC_018222	AACA	2	8	6104	6111	75 %	0 %	0 %	25 %	397698498
105	NC_018222	TTG	2	6	6123	6128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698498
106	NC_018222	CA	3	6	6151	6156	50 %	0 %	0 %	50 %	397698498
107	NC_018222	ATT	2	6	6158	6163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698498
108	NC_018222	A	6	6	6164	6169	100 %	0 %	0 %	0 %	397698498
109	NC_018222	ATCT	2	8	6197	6204	25 %	50 %	0 %	25 %	397698498
110	NC_018222	TTG	2	6	6207	6212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397698498
111	NC_018222	AAG	2	6	6213	6218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698498
112	NC_018222	TAA	2	6	6348	6353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698498
113	NC_018222	TA	3	6	6399	6404	50 %	50 %	0 %	0 %	397698498
114	NC_018222	TCA	2	6	6466	6471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397698498
115	NC_018222	TAT	2	6	6549	6554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698498
116	NC_018222	GGA	2	6	6561	6566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	397698498
117	NC_018222	AAT	2	6	6567	6572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698498
118	NC_018222	A	7	7	7124	7130	100 %	0 %	0 %	0 %	397698499
119	NC_018222	GAA	2	6	7173	7178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698499
120	NC_018222	ATT	2	6	7212	7217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698499
121	NC_018222	AAT	2	6	7224	7229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698499
122	NC_018222	GGT	2	6	7239	7244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	397698499
123	NC_018222	GACA	2	8	7283	7290	50 %	0 %	25 %	25 %	397698499
124	NC_018222	CTT	2	6	7420	7425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397698499
125	NC_018222	TTTGA	2	10	7470	7479	20 %	60 %	20 %	0 %	397698499
126	NC_018222	TTGC	2	8	7530	7537	0 %	50 %	25 %	25 %	397698499
127	NC_018222	ATT	3	9	7575	7583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397698499
128	NC_018222	AAT	2	6	7614	7619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698499
129	NC_018222	AGA	3	9	7661	7669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698499
130	NC_018222	ACAA	2	8	7674	7681	75 %	0 %	0 %	25 %	397698499
131	NC_018222	TGAT	2	8	7705	7712	25 %	50 %	25 %	0 %	397698499
132	NC_018222	GAA	2	6	7803	7808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698499
133	NC_018222	AGA	2	6	7826	7831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397698499
134	NC_018222	TAA	2	6	7865	7870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397698499
135	NC_018222	AGTA	2	8	7871	7878	50 %	25 %	25 %	0 %	397698499
136	NC_018222	A	6	6	7920	7925	100 %	0 %	0 %	0 %	397698499
137	NC_018222	TATG	2	8	7934	7941	25 %	50 %	25 %	0 %	397698499
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139	NC_018222	AGAAT	2	10	7994	8003	60 %	20 %	20 %	0 %	397698499
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.